Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms