Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PnckQ9QYK9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PnckQ9QYK9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms