Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Opn4Q9QXZ9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms