Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gde1Q9JL56 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gde1Q9JL56 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Gde1Q9JL56 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms