Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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