Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms