Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms