Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms