Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms