Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Hmg20aQ9DC33 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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