Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms