Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Smim23Q9DAL0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim23Q9DAL0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim23Q9DAL0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms