Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms