Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms