Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptp4a3Q9D658 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptp4a3Q9D658 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptp4a3Q9D658 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptp4a3Q9D658 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptp4a3Q9D658 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptp4a3Q9D658 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ptp4a3Q9D658 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ptp4a3Q9D658 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ptp4a3Q9D658 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ptp4a3Q9D658 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ptp4a3Q9D658 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ptp4a3Q9D658 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptp4a3Q9D658 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptp4a3Q9D658 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ptp4a3Q9D658 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptp4a3Q9D658 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ptp4a3Q9D658 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ptp4a3Q9D658 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Ptp4a3Q9D658 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ptp4a3Q9D658 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ptp4a3Q9D658 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ptp4a3Q9D658 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptp4a3Q9D658 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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