Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms