Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms