Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D1F3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms