Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Mrpl28Q9D1B9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Mrpl28Q9D1B9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Mrpl28Q9D1B9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Mrpl28Q9D1B9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Mrpl28Q9D1B9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Mrpl28Q9D1B9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Mrpl28Q9D1B9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Mrpl28Q9D1B9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Mrpl28Q9D1B9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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