Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms