Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SdhdQ9CXV1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SdhdQ9CXV1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms