Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RpainQ9CWY9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RpainQ9CWY9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RpainQ9CWY9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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