Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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