Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdca4Q9CWM2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdca4Q9CWM2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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