Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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