Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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