Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl20Q9CQL4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms