Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms