Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms