Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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