Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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