Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms