Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms