Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms