Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms