Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gdpd3Q99LY2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms