Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Vmp1Q99KU0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Vmp1Q99KU0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Vmp1Q99KU0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Vmp1Q99KU0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vmp1Q99KU0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vmp1Q99KU0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vmp1Q99KU0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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