Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TirapQ99JY1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms