Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ophn1Q99J31 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ophn1Q99J31 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms