Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip1Q922J3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms