Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1bQ91YK2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp1bQ91YK2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms