Protein–RNA interactions for Protein: Q91X93

Prb1, Proline-rich protein BstNI subfamily 1, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prb1Q91X93 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prb1Q91X93 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prb1Q91X93 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms