Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms