Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK1

Snrnp25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp25Q8VIK1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp25Q8VIK1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms