Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp4Q8VHC5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms