Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms