Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
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Vmn1r200Q8R281 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Vmn1r200Q8R281 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Vmn1r200Q8R281 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Vmn1r200Q8R281 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Vmn1r200Q8R281 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Vmn1r200Q8R281 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Vmn1r200Q8R281 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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