Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms