Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f4Q8R0K9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms