Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms